| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (75 cycles) |
| mean length before filtering: | 40bp |
| mean length after filtering: | 28bp |
| duplication rate: | 35.714286% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 14 |
| total bases: | 563 |
| Q20 bases: | 449 (79.751332%) |
| Q30 bases: | 449 (79.751332%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 50.799290% |
| total reads: | 8 |
| total bases: | 230 |
| Q20 bases: | 214 (93.043478%) |
| Q30 bases: | 214 (93.043478%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 45.217391% |
| reads passed filters: | 8 (57.142857%) |
| reads with low quality: | 2 (14.285714%) |
| reads with too many N: | 1 (7.142857%) |
| reads too short: | 3 (21.428571%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAtatgcgacgaccagcagcagacgacg | 3 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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